Software

Seit über 20 Jahren betreute die ISCaD GmbH zahlreiche IT Projekte für öffentliche Einrichtungen, Kliniken, Sanitätshäuser und Telekommunikations-Anbieter.

Wir sind spezialisiert auf Java, Python, JavaScript, HTML5 und bieten eine langjährigen Expertise in den Bereichen der Datenaufbereitung, Datenanalyse und Darstellung.

Darüberhinaus erstellen wir Online Applikationen mit Tomcat, Jetty, WildFly, JBoss, Django, Gunicorn, Flask und Tornado, allen Arten von SQL Datenbanken und NoSQL Datenbanken.

Software – (Fast) alles was Sie wissen müssen

An dieser Stelle möchten wir Ihnen eine Artikelserie zum Thema Softwareentwicklung, Datenformate und Fachtermini vorstellen. Wenn Sie weitere Fragen haben, schreiben Sie uns eine Mail oder nutzen Sie unseren Chat.

Artikel 01Das HDF5 Datenformat

Bei dem HDF5 (HDF5 Group Copyright) Datenformat (OpenSource) handelt es sich um ein sehr anpassungsfähiges Datenmodel, das sehr komplexe heterogene Daten Objekte und eine breite Basis von Metadaten durch eine nicht begrenzte Variation von Datentypen repräsentieren kann.

Für Anwendungsapplikationen gibt es keine Begrenzungen in Bezug auf die Dateigröße des HDF5 Files.

HDF5 ist für die Hochgeschwindigkeitsaufnahme von Messwerten geeignet. Das selbst beschreibende Format benötigt keine externen Informationen, damit Applikationen die Struktur und Daten in einem File erfassen können.

Außerdem ist das HDF5 Format eine Lösung zur Langzeit Datenarchivierung.

Geht es um umfangreiche und komplex zusammenhängende erfasste Daten, zu denen wiederum auch umfassende Metadaten hinzukommen, die sie speichern und verarbeiten müssen, möchten wir ihnen das HDF5 Speicherformat empfehlen.

Charakterisierung des HDF5 Formats

Nehmen wir als Beispiel klinische Daten, mit denen wir viel Erfahrung gesammelt haben.

Betrachten wir den Fall von Herzoperationen/Kathetereingriffen. Um Aussagen über die Qualität und den Nutzen von solchen Eingriffen machen zu können, sind Langzeitstudien und eine umfangreiche Menge von komplex zusammenhängenden Daten notwendig. Um die notwendigen Daten für solch eine Studie zu skizzieren, haben wir folgende Form gewählt:

All diese Informationen zu einem Patienten inkl. Metadaten lassen sich im HDF5 Format leicht ablegen, aus dieser Struktur heraus können Auswertungen und die Auswertungsergebnisse wiederum zum Patienten in einer weiteren Gruppe abgelegt werden. Natürlich ist dies nicht nur für einen, sondern für beliebig viele Patienten möglich.

Aufgrund der flexiblen Struktur müssen bei großen Datenvolumen nicht komplette Datensätze geladen werden, es ist einfach möglich, nur Teile von großen Datensätzen gezielt für die Verarbeitung zu entnehmen.

Auch Word Dokumente oder Bilder können im HDF5 Format abgelegt und für den Langzeit Betrieb zur Verfügung gestellt werden.

Das HDF5 Format macht es möglich z.B. Projekte mit allen Metadaten, Messwerten, graphischen Darstellungen und Dokumenten sowie Kommunikationsdaten sicher und sehr Plattform portable zu speichern.

Sie möchten mehr über HDF5 erfahren? Kontaktieren Sie uns gerne per Email oder nutzen Sie unseren Chat.

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